美國國立衛生研究院(NIH)資助的研究團隊早前完成了一份大規摸詳細的基因組分析,被稱之為泛癌症圖譜(PanCancer Atlas)。它收錄了 27 篇論文,包括 33 種癌症、1 萬多個種不同腫瘤分子和臨床訊息的數據資料。
泛癌症圖譜
泛癌症圖譜主要針對癌症基因組圖譜(TCGA),自 2006 年開始由美國國家癌症研究所(NCI)和國家人類基因組研究所(NHGRI)共同執行,持續了 10 多年的時間,共投入了超過 3 億美元的資金,涉及近 20 個機構,約 150 名研究人員共同參與。NHGRI 團隊負責人 Carolyn Hutter 表示,TCGA 是第一個在分子層面上,針對廣泛類型癌症研究的項目,在 TCGA 項目的草創之時,有些內容甚至是不可能實現的,更別提在廣大的範圍進行特徵和類型分析。
TGCA 已經在《細胞》(Cell)期刊上刊出,隨著長達十幾年研究工作告一段落,團隊將會在 9 月 27 至 29 日期間,,在華盛頓舉行為期三天研討會,討論泛癌症圖譜及未來大型的癌症研究,介紹癌症基因治療的最新進展,並展示近期靶向治療的過程。
前所未有的角度
TCGA 不僅包含癌症基因組測序,基因調查、蛋白質表達譜等不同類型的數據也曾進行分析,並將其與臨床及影像數據連結,NIH 院長 Francis S. Collins 認為,這個項目是十多年來開創性工作的精華所在,分析能帶領癌症研究人員從前所未有的角度,去理解腫瘤是如何、在哪些部位以及為什麼會在人體上出現,為未來的臨床實驗和治療提供更好的成效。
泛癌症圖譜的內容分為 3 個主要類別,每個類別都以一篇摘要論文為基礎,以描述該主題的核心結果,再以多份報告深入探索這些類別中的各個主題,主要議題包含了細胞起源、致癌過程以及致癌途徑。
摘要論文
在第一篇摘要論文中,作者總結了一系列使用「molecular clustering」技術分析的結果,這項技術透過基因表現、腫瘤細胞中的染色體數目異常或 DNA 修飾(DNA modifications等參數,對腫瘤進行分組,幫助外界理解原發腫瘤組織如何影響癌症特徵,進而有望對各種癌症類型找出更具體的治療。
在其他方面,收集了 TCGA 研究中對致癌過程的廣泛觀點,包含腫瘤基礎基因組、表觀基因組對蛋白質表達的影響及腫瘤與免疫細胞的相互作用,並確認了 3 個關鍵的致癌基因進程:突變、雙生殖細胞(先天遺傳)和體細胞(後天),發現將有助於確定針對各種癌症的新療法和免疫療法的開發優先性。
在最後總結的摘要論文中,介紹了 TCGA 對基因組在訊息傳遞途徑中改變的詳細研究,比較這些不同類型癌症中出現時的相似性及差異性,揭露癌症潛在脆弱性的新模式,幫助未來開發聯合療法和個人化醫療。
資料來源:NIH
Text by Fortune Insight