《路透》等外媒上周五（2日）報導，負責美國出口管制的美國商務部將28個內地企業及個人列入俗稱貿易黑名單的出口管制名單「實體名單」（Entity list），當中包括華大基因旗下華大生命科學研究院（BGI Research）和香港華大基因科技服務（BGI Tech Solutions (Hongkong)），指控他們收集及分析的基因數據存在轉移到中國軍事項目的重大風險，可能協助中國政府進行監控，以壓迫少數民族。
根據規定，一旦一間公司被添加到實體清單，即代表禁止美國供應商向其出售技術。美國供應商必須獲得特別的出口許可證，才能向該公司運送低技術含量的產品。而該出口許可證難以獲得。
華大周六（4日）在網站發表聲明指，近日關注到，美國商務部工業與安全局於當地時間2023年3月2日發布「實體清單」，其中包括華大基因子公司香港華大基因科技服務有限公司（香港科技）。
華大稱，華大基因是一家以技術創新為驅動的企業，致力於精準醫學服務，抑制重大疾病對人類的危害。華大基因恪守商業道德，嚴格遵守國際商業慣例及法律法規，在全球範圍內合規開展相關業務，致力於為各個國家和地區的公眾健康做出積極貢獻。公司相關服務和產品從未涉及任何軍事用途，皆為民用或商用。
華大表示，香港科技此次被列入實體清單的具體原因，有待進一步溝通核實。香港科技2022年度實現的營業收入佔公司營收比例較低。香港科技此次被列入美國商務部實體清單不會對公司經營產生實質性影響。目前公司生產經營及財務情況正常，各項業務穩步推進。公司將做好各項應對工作，持續關注和跟進後續該事件的發展情況，並將積極與相關部門保持溝通。
《彭博》報導，華大回覆傳媒查詢表示，反對美國對其部份子公司實施出口限制的決定，並將繼續倡導開放和包容的全球科學合作，指出美國商務部的決定可能受到錯誤資訊的影響，集團願意並且能夠澄清。
聲明稱，集團的任何部份都不是國有或國家控制的，其所有服務和研究都是為了民用和科學目的，華大基因永遠不會參與侵犯人權的行為。
美國商務部早於2020年已將華大基因兩間子公司列入其經濟黑名單，分別為北京六合華大基因（Beijing Liuhe BGI）及新疆絲路華大基因（Xinjiang Silk Road BGI）。美國當局當時指控那些公司進行基因分析，以進一步打壓維吾爾族。北京否認有不當行為，華大基因當時也否認有關指控，表示子公司被列入名單沒有依據，公司嚴格遵守所有國際商業慣例和法律。
雲端運算、伺服器公司浪潮集團（Inspur）亦被列入貿易黑名單。美國商務部指控浪潮試圖採購美國商品，以支援中國軍事現代化。
中國外交部發言人毛寧上周五（3日）舉行例行記者會時回應事件稱，美國將一批中國企業列入貿易黑名單，這是美國捏造藉口，不擇手段打壓中國企業的又一例證，中方對此表示強烈不滿及堅決反對，將繼續堅定維護本國企業的正當合法權益，支持中國企業依法維護自身權益。
毛寧又說中方敦促美方尊重基本事實，摒棄意識形態偏見，停止濫用各種借口，無理打壓中國企業，為中國企業經營提供公正及非歧視待遇。