有本地傳媒報道，香港中文大學（下稱「中大」）旗下教學醫院2021/22年度錄得赤字8.6億元，較2020/21年度的6,900萬元漲逾11倍。有關赤字使中大的整體財務狀況由只計本部的2億多元盈餘變成「大學整體」的近6億元虧蝕。
中大回覆查詢時表示，中大醫院虧損緣於疫情影響下收入不勝預期，加上醫院正處於起步發展階段，每年涉及建築與設備3億多元的賬面折舊所致，強調虧損並非結構性問題，有信心隨着疫情緩和經濟復常，醫院可按部就班陸續開設床位，預計收入不久後將能支付營運費用，而中大校方亦會大力協助醫院籌募經費，以保醫院長遠發展。
中大解釋，中大醫院是獨立自資營運機構，財政與中大分開管理，但因醫院屬中大全資子公司，按會計制度及法例要求，其收支及財務狀況須合併於中大財務報表中。