根據政府提供的數字，過去近三年，各部門合共做了5,300萬次核酸檢測，估計動用了70至80億元公帑。有專家認為，不應太重視使費，最重要是控制疫情，以減少對社會的影響。
《頭條日報》向醫務衞生局查詢過去進行3年核酸檢測的次數，獲回覆指，由2020年11月起至2022年8月底，局方在社區檢測中心和流動採樣站、圍封強檢行動中的檢測合共做了3,730萬次核酸檢測。而截至今年4月，相關開支約58億元。衞生署及醫務衞生局亦提供數字，由2020年初至今，一共做了核酸檢測近1,600萬次。換言之，各部門合共做了最少5,300萬次核酸檢測。根據推算，如此數量的核酸檢測，最少動用了70至80億公帑。
呼吸系統科專科醫生梁子超接受傳媒查詢時說，不應過份放大使費數字，表示須一併考慮新冠疫情對本港社會、經濟的整體影響。他亦指，核酸檢測可以有效追蹤傳播鏈，相比起內地，香港的核酸檢測數目已不算多。不過，梁子超認為，新冠病毒有機會風土化，預期若病毒無重大的變種，而香港社會又達至混合免疫，即打針及確診者均免疫，將來就可以減少核酸檢測次數。但他強調，接種疫苗可以防重症出現，呼籲老幼應盡快去打針。
另外，中大生物醫學學院客座副教授、本港檢測承辦商「相達生物科技」創辦人招彥燾亦表示，相關花費「絕對值得」。相比起快速檢測，核酸檢測更準確地追蹤病毒的傳播鏈，如果沒有核酸檢測，今年年初爆發的第五波疫情，將會更加嚴重。招彥燾指，現時市民到私人檢測中心做一次核酸檢測，收費240元，而政府外判的價格較低。他透露，本港現時有十多間化驗所，有能力做核酸檢測。前年秋天，政府設立社區檢測中心時，有5間化驗所承辦核酸檢測服務，現時加至9間，相信下一輪招標將有多於9間提供服務，預料政府的外判價格或會再下跌。